اصول طیف سنجی جرمی جلوتر از تكنیك های دستگاهی دیگر، IR,CNMR,HNMR,UV بنا نهاده شده است. تاریخ پایه گذاری اصول اساسی آن به سال 1898 بر می گردد.قدیمی ترین طیف سنج جرمی در سال 1918 ساخته شد. اما روش طیف سنجی جرمی تا همین اواخر كه دستگاه های دقیق ارزانی در دسترس قرار گرفتند، هنوز مورد استفاده چندانی نداشت. این تكنیك با پیدایش دستگاه های تجاری كه به سادگی تعمییر و نگهداری می شوند و با توجه به مناسب بودن قیمت آن ها برای بیشتر آزمایشگا های صنعتی و آموزشی و نیز بالا بودن قدرت تجزیه و تفكیك، در مطالعه تعیین ساختمان تركیبات از اهمیت بسیاری بر خوردار گشته است.

 

به بیان ساده طیف سنجی جرمی سه عمل اساسی انجام می دهد:

  1. مولكول ها توسط جریانی از الكترون های پر انرژی بمباران شده و بعضی از مولكول ها به یون های مربوطه تبدیل می گردد.
  2. یون های شتاب داده شده بسته به نسبت  آنها در یك میدان مغناطیسی یا الكتریكی جدا می گردند.و در نهایت این كه یونهای دارای نسبت  مشخص و معین، توسط بخشی از دستگاه كه در اثر برخورد یونها به آن قادر به شمارش آنهاست آشكار می گردند. نتایج داده شده خروجی توسط آشكار كننده بزرگ شده و به ثبات داده می شوند. علامت یا نقشی كه از ثبات حاصل می گردد یك طیف جرمی است- نموداری از تعداد ذرات آشكار شده بر حسب تابعی از نسبت  .

باید توجه داشت كه قبل از تشكیل یون ها باید راهی پیدا كرد تا بتوان جریانی از مولكول ها را به محفظه ی یونیزاسیون، كه عمل یونیزه شدن در آن انجام می گیرد، روانه ساخت. یك سیستم ورودی نمونه، برای ایجاد چنین جریانی از مولكول ها به كار برده می شود.

نمونه هایی كه با طیف سنجی جرمی مورد مطالعه قرار می گیرند می توانند به حالت گاز،مایع یا جامد باشند. در این روش باید از وسایلی استفاده كرد تا مقدار كافی از نمونه را به حالت بخار در آورده سپس جریانی از مولكولها روانه محفظه ی یونیزاسیون شوند. در مورد گازها، ماده خود به حالت بخار وجود دارد پس، از سیستم ورودی ساده ای می توان استفاده كرد. این سیستم تحت خلا بوده بطوری كه محفظه ی یونیزاسیون در فشاری پایین تر از سیستم ورودی نمونه قرار دارد. نمونه به انبار بزرگتری رفته كه از آن، مولكولهای بخار به محفظه یونیزاسیون می روند. برای اطمینان از این كه جریان یكنواختی از مولكولها به محفظه ی یونیزاسیون وارد می شود، قبل از ورود،بخار از میان سوراخ كوچكی كه روزنه ی مولكولی خواندهمی شودعبور می كند. همین سیستم برای مایعات و جامدات فرّار نیز به كار برده می شود. برای مواد با فراریت كم، می توان سیستم را به گونه ای طراحی كرد كه در یك اجاق یا تنور قرار گیرد تا در اثر گرم كردن نمونه، فشار بخار بیشتری حاصل گردد. باید مراقب بود تا حرارت زیاد موجب تخریب ماده نگردد.

در مورد مواد جامد نسبتا غیر فرار، روش مستقیمی را می توان بكار برد. نمونهئ در نوك میله ای قرار داده می شود و سپس از یك شیر خلا وارد محفظه ی یونیزاسیون می گردد. نمونه در فاصله ی بسیار نزدیكی از پرتو یونیزه كننده الكترون ها قرار می گیرد. سپس آن میله گرم شده و تولید بخاری از نمونه را كرده تا در مجاورت پرتو الكترونها بیرون رانده شوند. چنین سیستمی را میتوان برای مطالعه ی نمونه ای از مولكولهایی كه فشار بخار آنها در درجه حرارت اتاق كمتر از  میلی متر جیوه است به كار برد.

هنگامی كه جریان مولكولهای نمونه وارد محفظه ی یونیزاسیون گشت، توسط پرتویی از الكترونها پر انرژی بمباران می شوند. در این فرایند، مولكولها به یونهای مربوطه تبدیل گشته و سپس در یك میدان الكتریكی شتاب داده می شوند.

در محفظه ی یونیزاسیون، پرتو الكترون های پر انرژی از یك سیم باریك گرم شده ساطع می شوند. این سیم باریك تا چند هزار درجه سلسیوس گرم می شود. به هنگام كار در شرایط معمولی، الكترون ها دارای انرژی ای معادل 70 الكترون ولت هستند. این الكترون های پر انرژی با مولكولهایی كه از سیستم نمونه وارد شده اند برخورد كرده و با برداشتن الكترون از آن مولكول ها، آنها را یونیزه كرده و به یونهای مثبت تبدیل می كنند. یك صفحه ی دافع كه پتانسیل الكتریكی مثبتی دارد یون های جدید را به طرف دسته ای از صفحات شتاب دهنده هدایت می كند. اختلاف پتانسیل زیادی (حدود 1 تا 10كیلو وات)، از این صفحات شتاب دهنده عبور داده می شود كه  این عمل، پرتویی از یونهای مثبت سریع الحركت را تولید می كند. این یون ها توسط یك یا چند شكاف تمركز دهنده به طرف یك پرتو یكنواخت هدایت می شود.

بسیاری از مولكول های نمونه به هیچ وجه یونیزه نمی شوند. این مولكول ها به طور مداوم توسط مكنده های (پمپ های)خلا كه به محفظه ی یونیزاسیون متصل هستند، خارج می گردند.بعضی از این مولكول ها از طریق جذب الكترون به یون های منفی تبدیل می شوند. این یون های منفی توسط صفحه ی دافعه جذب می گردند. ممكن است كه بخش كوچكی از یون های تشكیل شده بیش از یك بار داشته باشند(از دست دادن بیش از یك الكترون). این ها همانند یون های مثبت تك ظرفیتی، شتاب داده می شوند.

انرژی لازم برای برداشتن یك الكترون از یك اتم یا مولكول، پتانسیل یونیزاسیون آن است. بسیاری از تركیبات آلی دارای پتانسیل یونیزاسیونی بین 8 تا 15 الكترون هستند. اما اگر پرتو الكترون هایی كه به مولكول ها برخورد می كند پتانسیلی معادل 50 تا 70 الكترون ولت نداشته باشد، قادر به ایجاد یون های زیادی نخواهد بود. برای ایجاد یك طیف جرمی، الكترون هایی با این میزان انرژی برای یونیزه كردن نمونه به كار برده می شوند.

پس از گذر كردن از محفظه ی یونیزاسیون، پرتو یون ها از درون یك ناحیه ی كوتاه فاقد میدان عبور می كند. سپس آن پرتو وارد تجزیه گر جرمی شده كه در آن یون ها بر حسب نسبت  آنها جدا می شوند.

انرژی جنبشی یك یون شتاب داده شده برابر است با:

 كه m جرم یون، v سرعت یون، e اختلاف پتانسیل صفحات شتاب دهنده یون است. در حضور یك میدان مغناطیسی، یك ذره ی باردار مسیر منحنی شكلی را خواهد داشت. معادله ای كه شعاع این مسیر منحنی شكل را نشان می دهد به صورت زیر است:

كه r شعاع انحنای مسیر و H قدرت میدان مغناطیسی است. اگر این دو معادله را با هم تركیب كنیم خواهیم داشت:

 

این معادله مهمی است كه رفتار و عمل یك یون را در بخش تجزیه گر جرمی یك طیف سنج جرمی توجیه می كند.

هر قدر مقدار  بزرگتر باشد، شعاع انحنای مسیر نیز بزرگتر خواهد بود. لوله ی تجزیه گر دستگاه طوری ساخته شده كه دارای شعاع انحنای ثابتی است. ذره ای كه نسبت  صحیحی را داشته باشد قادر خواهد بود تا طول لوله ی تجزیه گر منحنی شكل را طی كرده و به آشكار كننده برسد. ذراتی كه نسبت  آنها بی اندازه بزرگ بوده و یا بی اندازه كوچك باشند، به كناره های لوله ی تجزیه گر برخورد كرده و به آشكار كننده نمی رسند. مسلما اگر دستگاه، یون هایی را به جرم بخصوصی دارند نشان می دهد، این روش چندان جالب نخواهد بود. بنابراین به طور مداوم ولتاژ شتاب دهنده یا قدرت میدان مغناطیسی تغییر یافته تا بتوان كلیه ی یون هایی كه در محفظه ی یونیزاسیون تولید گشته اند را آشكار ساخت. اثری كه از آشكار كننده حاصل می گردد به صورت طرحی است كه تعداد یون ها را بر حسب مقدار   آنها رسم می كند.

برای رسیدن به قدرت تفكیك بالا، تغییراتی در طرح دستگاه اصلی داده می شود. از آن جا كه ذراتی كه محفظه ی یونیزاسیون را ترك می كنند همگی سرعت یكسانی ندارند، می توان از یك طیف سنج جرمی تمركز دهنده ی مضاعف استفاده كرد. در چنین دستگاهی پرتو یون ها قبل از ورودبه میدان مغناطیسی از میدانی الكتریكی عبور می كند. در حضور میدان الكتریكی، ذرات، همگی با یك سرعت حركت كرده و بنابراین قدرت تفكیك ناحیه ی میدان مغناطیسی بهبود می یابد.

آشكار كننده بسیاری از دستگاه ها شامل یك شمارشگر است كه جریان تولیدی آن متناسب با تعداد یون هایی است كه به آن برخورد می كند. با استفاده از مدارهای الكترون افزاینده (electron multiplier circuits) می توان آن قدر دقیق این جریان را اندازه گرفت كه جریان حاصل از برخورد فقط یك یون به آشكار كننده اندازگیری شود. سیگنال تولید شده از آشكار كننده به یك ثبات داده می شود كه این ثبات خود طیف جرمی را ایجاد می نماید. در دستگاه های جدید، خروجی آشكار كننده از طریق یك سطح مشترك به رایانه متصل است. رایانه قادر به ذخیره اطلاعات بوده و خروجی رابه هر دو صورت جدولی و گرافیكی در ما آورد. دست اخر داده ها با طیف های استاندارد ذخیره شده ی موجود در رایانه مقایسه می گردد. در دستگا های قدیمیتر، جریان الكترونی حاصل از آشكار كننده به یك سری از پنج گالوانومتر با حساسیت های متفاوت داده می شود. حساسیت فركانس گالوانومترها به نسبت های 1، ، ، ، است . پرتو نوری كه به آینه های متصل به گالوانومترها بر خورد می كند به یك صفحه ی حساس به نور منعكس می گردد. بدین طریق یك طیف جرمی با پنج نقش به طور همزمان، هر یك با حساسیتی متفاوت؛ ایجاد می شود. در حالی كه هنوز دستگاه، قوی ترین قله ها را در صفحه ی نمایش طیفنگاه می دارد، با استفاده از این پنج نقش ثبت ضعیف ترین قله ها نیز ممكن می گردد.